Война застала футболистов столичного «Динамо» в Минске. Поскольку команда входила в структуру НКВД и была полувоенным коллективом, то уже на второй день войны динамовцам выдали обмундирование, оружие и приказали отправляться в… Москву.

Как рассказывал после войны один из игроков той команды Николай Шевелянчик, футболисты самостоятельно подыскали в горящем городе грузовик, на котором и направились по Могилевскому шоссе в сторону Москвы, каждую минуту рискуя попасть под бомбардировку либо нарваться на вражеский десант. Ехали, пока не закончился бензин. А так как заправиться было негде, то дальше шли пешком в толпе беженцев, покидавших разрушенный немецкой авиацией Минск.

В Могилеве футболистам помог первый секретарь ЦК БССР Пантелеймон Пономаренко, выделивший две машины, на которых команда доехала до Смоленска, а оттуда кое-как добралась и до Москвы.

По прибытии в столицу футболисты отправились на стадион «Динамо». Здесь в июле 1941–го формировалась Отдельная мотострелковая бригада особого назначения - знаменитый ОМСБОН. В нее входили 800 лучших спортсменов страны, а также рабочие московских предприятий, преподаватели и курсанты школ НКВД, чекисты-оперативники, пограничники. В состав этой бригады были зачислены и минские футболисты. ОМСБОН нес патрульную службу, участвовал в создании оборонительных рубежей, минировании важных объектов, осуществлял разведывательные и диверсионные действия на оккупированной врагом территории.

В октябре 1941 года, когда Москва была объявлена на осадном положении, временно стал частью гарнизона столицы и принимал участие в боевых действиях в Подмосковье. 7 ноября 1941 года в составе ОМСБОН футбольная команда минского «Динамо» во главе со старшим тренером Львом Корчебоковым участвовала в параде советских войск на Красной площади.

После того как враг был отброшен от Москвы, бывшие футболисты несли патрульную службу, охраняли военные объекты. Многие просились на фронт, но отпустили лишь некоторых. Костяк команды сохранился, и после переломной победы под Сталинградом из динамовцев вновь сформировали футбольную команду, которая некоторое время выступала в первенстве Москвы под названием «Воинская часть майора Иванова». Чуть позже команду переименовали в «Динамо-2». В 1944 году динамовская дружина уже играла в Кубке СССР, причем дошла до полуфинала.